MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Shewanella piezotolerans WP3 chromosome

Total Repeats: 15746

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011566	TTA	2	6	34	39	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011566	TGATC	2	10	121	130	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3	NC_011566	GATCA	2	10	223	232	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4	NC_011566	ATA	2	6	235	240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011566	ATA	2	6	833	838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011566	CTG	2	6	906	911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_011566	TCAAC	2	10	947	956	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
8	NC_011566	AAT	2	6	1043	1048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011566	T	6	6	2533	2538	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011566	ATTT	2	8	2541	2548	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011566	GTTT	2	8	3342	3349	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011566	GTT	2	6	3365	3370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011566	TTA	2	6	3440	3445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011566	A	6	6	3474	3479	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011566	A	6	6	5779	5784	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011566	TTTA	2	8	5798	5805	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011566	GTC	2	6	5871	5876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_011566	ACT	2	6	5886	5891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_011566	TGTA	2	8	5946	5953	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011566	ATC	2	6	5991	5996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_011566	TCG	2	6	6002	6007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_011566	AAAT	2	8	6024	6031	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011566	AGT	2	6	6056	6061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011566	AGG	2	6	6129	6134	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011566	ACC	2	6	6161	6166	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_011566	AGG	2	6	6242	6247	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011566	ACC	2	6	6274	6279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_011566	TAA	2	6	6286	6291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011566	CCA	2	6	6295	6300	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_011566	TTA	2	6	6334	6339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011566	TG	3	6	6345	6350	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011566	AT	3	6	6358	6363	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011566	AGT	2	6	7650	7655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011566	TAT	2	6	7674	7679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011566	ATCAAG	2	12	7699	7710	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_011566	TA	3	6	7728	7733	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011566	A	6	6	7768	7773	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011566	GTT	2	6	8536	8541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011566	ATG	2	6	8555	8560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011566	AT	3	6	8678	8683	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011566	TAAT	2	8	8778	8785	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011566	AAT	2	6	8862	8867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011566	TTA	2	6	8899	8904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011566	AAAT	2	8	8907	8914	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011566	TCT	2	6	8915	8920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_011566	T	7	7	11578	11584	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011566	CTTT	2	8	11589	11596	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_011566	T	8	8	11636	11643	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011566	TAAA	2	8	11659	11666	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011566	TGA	2	6	11702	11707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011566	TTG	2	6	11743	11748	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011566	TGA	2	6	11858	11863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011566	A	6	6	13327	13332	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011566	TGT	2	6	13333	13338	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011566	ATAG	2	8	13345	13352	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011566	A	6	6	13354	13359	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011566	T	6	6	15060	15065	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011566	TCT	2	6	15079	15084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_011566	TTA	2	6	15227	15232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011566	AAT	2	6	15249	15254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011566	CTA	2	6	15628	15633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_011566	TAA	2	6	15796	15801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011566	A	6	6	15833	15838	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011566	CTT	2	6	15907	15912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_011566	TTC	2	6	15919	15924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_011566	CTA	2	6	15937	15942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_011566	TAG	2	6	15987	15992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011566	TAT	2	6	16018	16023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011566	GATC	2	8	16025	16032	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_011566	T	7	7	16072	16078	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011566	ATCT	2	8	16123	16130	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_011566	CTT	2	6	18800	18805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_011566	T	6	6	18809	18814	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011566	CGA	2	6	19922	19927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_011566	GA	3	6	19926	19931	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011566	TTA	2	6	22369	22374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011566	T	8	8	22411	22418	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011566	TTA	2	6	22464	22469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011566	A	6	6	23554	23559	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011566	T	6	6	26668	26673	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011566	TGGT	2	8	26677	26684	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011566	GTA	2	6	27298	27303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011566	CAT	2	6	27381	27386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_011566	AAT	2	6	27442	27447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011566	A	6	6	27457	27462	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011566	T	6	6	27491	27496	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011566	AATT	2	8	27533	27540	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011566	AGTTA	2	10	27562	27571	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011566	T	8	8	30807	30814	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011566	GTT	2	6	30818	30823	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011566	TTG	2	6	30838	30843	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011566	ATGGG	2	10	30944	30953	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011566	GTG	2	6	30964	30969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011566	TGT	2	6	30983	30988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011566	TATC	2	8	30992	30999	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_011566	GGC	2	6	31015	31020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_011566	GAGT	2	8	31513	31520	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011566	AGG	2	6	31794	31799	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011566	TTAT	2	8	31820	31827	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011566	GTT	2	6	32897	32902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011566	ACC	2	6	32918	32923	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_011566	T	6	6	32964	32969	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011566	T	8	8	33038	33045	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011566	GTT	2	6	33077	33082	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011566	AT	3	6	33086	33091	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011566	TGT	2	6	33098	33103	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011566	GT	3	6	33111	33116	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011566	GAT	2	6	33140	33145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011566	AAG	2	6	36599	36604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011566	CTTC	2	8	36616	36623	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_011566	T	6	6	36628	36633	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011566	T	6	6	36639	36644	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011566	TGA	2	6	36658	36663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011566	TGG	2	6	36698	36703	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011566	A	6	6	38020	38025	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011566	T	7	7	38042	38048	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011566	TGC	2	6	39239	39244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_011566	CT	3	6	41457	41462	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_011566	T	6	6	41462	41467	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011566	CAT	2	6	41482	41487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_011566	GTT	2	6	41495	41500	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011566	ACA	2	6	41530	41535	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_011566	TTAT	2	8	41571	41578	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011566	TTA	2	6	41583	41588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011566	CAAT	2	8	41594	41601	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_011566	T	6	6	41631	41636	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011566	ACT	2	6	41654	41659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_011566	TAAA	2	8	41696	41703	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011566	TG	3	6	41706	41711	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011566	AT	3	6	41779	41784	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011566	TAA	2	6	41808	41813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011566	G	6	6	41816	41821	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011566	ATTC	2	8	42582	42589	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_011566	TCA	2	6	42592	42597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_011566	TGC	2	6	42608	42613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_011566	CAA	2	6	42767	42772	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_011566	TCC	2	6	42792	42797	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_011566	TTA	2	6	42821	42826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_011566	AG	3	6	44131	44136	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_011566	ACG	2	6	44559	44564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_011566	TACC	2	8	53145	53152	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_011566	ATA	2	6	53192	53197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_011566	CTT	2	6	54554	54559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_011566	TCAT	2	8	54581	54588	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
145	NC_011566	GTTG	2	8	55238	55245	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_011566	AAT	2	6	55341	55346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_011566	GCTAA	2	10	56807	56816	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
148	NC_011566	CTA	2	6	56873	56878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_011566	TAA	2	6	57438	57443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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151	NC_011566	TAA	2	6	57454	57459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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288	NC_011566	GTT	2	6	86160	86165	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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291	NC_011566	T	6	6	87810	87815	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
292	NC_011566	ACA	2	6	87842	87847	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
293	NC_011566	TTAA	2	8	89061	89068	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
294	NC_011566	TTAT	2	8	92105	92112	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
295	NC_011566	TTG	2	6	92128	92133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
296	NC_011566	TAA	2	6	92234	92239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
297	NC_011566	TTGT	2	8	92252	92259	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
298	NC_011566	GCTTGA	2	12	92287	92298	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
299	NC_011566	ATT	2	6	92301	92306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
300	NC_011566	TATT	2	8	92311	92318	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
301	NC_011566	AGC	2	6	99722	99727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
302	NC_011566	ATGGC	2	10	100296	100305	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
303	NC_011566	CT	3	6	100357	100362	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
304	NC_011566	GTTCT	2	10	100663	100672	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
305	NC_011566	CAA	2	6	100716	100721	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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312	NC_011566	CTC	2	6	101056	101061	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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314	NC_011566	TGA	2	6	101135	101140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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316	NC_011566	ATG	2	6	101169	101174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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318	NC_011566	TTTA	2	8	101352	101359	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
319	NC_011566	TGA	2	6	104356	104361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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321	NC_011566	GT	4	8	104458	104465	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
322	NC_011566	T	7	7	104465	104471	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
323	NC_011566	T	6	6	104516	104521	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
324	NC_011566	GTT	2	6	104586	104591	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
325	NC_011566	ATCT	2	8	104642	104649	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
326	NC_011566	TAGT	2	8	110708	110715	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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334	NC_011566	ACT	2	6	110979	110984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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338	NC_011566	TTG	2	6	111334	111339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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420	NC_011566	AGT	2	6	131807	131812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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422	NC_011566	CTC	2	6	131882	131887	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
423	NC_011566	CAC	2	6	131888	131893	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
424	NC_011566	CTT	2	6	131894	131899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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426	NC_011566	TTC	2	6	131987	131992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
427	NC_011566	ATT	2	6	132105	132110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
428	NC_011566	AATT	2	8	132129	132136	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
429	NC_011566	AGG	2	6	136587	136592	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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431	NC_011566	CAT	2	6	136653	136658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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433	NC_011566	T	8	8	137925	137932	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
434	NC_011566	AAT	2	6	137978	137983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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436	NC_011566	TA	3	6	138009	138014	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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441	NC_011566	A	6	6	138925	138930	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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454	NC_011566	T	6	6	143751	143756	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
455	NC_011566	GTAG	2	8	143771	143778	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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459	NC_011566	CAT	2	6	143993	143998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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463	NC_011566	TCA	2	6	144160	144165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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493	NC_011566	ACA	2	6	152673	152678	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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500	NC_011566	TATC	2	8	152902	152909	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding

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